Seit 2003 ist das Gebiet der Cayos Cochinos ein Meeresschutzgebiet. Die Riffe gehören zum zweitgrößten Barriereriff der Welt. Das Mesoamerikanischen Barriere Riff erstreckt sich von hier über Belize bis nach Mexiko. Auf der Cochino Menor befindet sich die Ranger-Station, von der aus die Beobachtung und Forschung am Riff betrieben wird.